A los cuatro años, Warren Zaïre-Emery comenzó a jugar al fútbol en Aubervilliers. El jugador nacido en Montreuil fue rápidamente descubierto por el Paris Saint-Germain e impresionó por su precocidad. Warren fue promocionado constantemente a categorías superiores durante su formación.
A los 15 años, el centrocampista era titular indiscutible con el equipo Sub-19 e incluso ayudó a su equipo a clasificarse para los octavos de final de la Youth League siendo decisivo en dos ocasiones ante el Brujas (3-2). Estas actuaciones le llevaron directamente al grupo profesional cuando aún no había cumplido 16 años.
En 2022, Warren Zaïre-Emery conquistó el Campeonato de Europa Sub-17 con Francia y fue elegido mejor jugador del torneo. Unas semanas después, se convirtió en el jugador más joven de la historia del club en disputar un partido oficial al entrar ante el Clermont con 16 años, 4 meses y 29 días. Warren Zaïre-Emery siguió batiendo récords de precocidad en la Ligue 1 y en la Champions League, donde se convirtió en el jugador más joven de la historia del Paris Saint-Germain en ser titular en un partido de eliminatorias, ante el Bayern de Múnich.
Desde entonces, el internacional francés se ha consolidado como una pieza esencial del vestuario de Luis Enrique, contribuyendo especialmente a las dos conquistas de la Champions League y a los numerosos títulos nacionales logrados desde su debut como profesional en el verano de 2022.