Nascido em Arpajon a 23 de julho de 2007, Quentin Ndjantou começou na sua cidade natal em 2013, antes de prosseguir a formação no Paris FC, um ano mais tarde. Depois de passar pelo US Villejuif, ingressou no centro de formação do Paris Saint-Germain em 2020.
Rapidamente demonstrou o seu valor na equipa Sub-19, sagrando-se campeão em 2024 e 2025. Na sua segunda temporada, foi também eleito Titi d’Or. Estas prestações permitiram-lhe assinar o primeiro contrato profissional com o clube da capital a 28 de julho de 2025. Dois meses depois, estreou-se como profissional frente ao AJ Auxerre, antes de descobrir a Champions League alguns dias mais tarde contra o Barcelona.
Contribuiu assim para a segunda Champions League conquistada pela equipa de Luis Enrique e acrescentou também o primeiro título da Ligue 1 da sua carreira ao seu palmarés.