Nacido el 31 de julio de 2002 en Roskilde (Dinamarca), Mikkel Lovkvist debutó como profesional en el Fredericia HK en 2019. Dos años más tarde fichó por el Bjerringbro-Silkeborg, otro equipo de la máxima categoría danesa.
Rápidamente se consolidó como uno de los mayores talentos del campeonato. Tras convertirse en una pieza clave en la competición doméstica, debutó en el panorama continental durante la campaña 2024-2025 de la EHF European League de su club. En el verano de 2025 dio un nuevo paso en su carrera al incorporarse al Paris Saint-Germain Handball. Ya en su primera temporada se reveló como una de las grandes sensaciones de la Daikin StarLigue.
El joven guardameta danés terminó su primera campaña en el primer puesto de la clasificación de porteros por porcentaje de paradas, con un 33,95 % de lanzamientos detenidos. Fichado inicialmente hasta 2027, Mikkel Lovkvist vio recompensado rápidamente su buen rendimiento con una ampliación de contrato hasta 2029.